Methoden

Präparative und analytische biochemische Methoden

  • analytische, präparative, native, SDS und Immun-Gelelektrophoresen
  • analytische und präparative isoelektrische Fokussierung
  • Blotting
  • FPLC, HPLC
  • präparative und analytische Gelchromatographie (SEC, IEX, HIC)
  • präparative Ultrazentrifugation

Biochemisches Einfrieren von Konformationen, Verfolgen von Konformationsübergängen

  • chemisches Crosslinken
  • Crosslinken durch Antikörper
  • Markieren mit Fluorophoren

Spektroskopie

  • Absorptions-Spektroskopie
  • Differenz-Spektroskopie
  • Fluoreszenz-Spektroskopie
  • CD-Spektroskopie

Thermodynamische Messung der Stabilität, Faltung und der Wechselwirkung zwischen Proteinen

  • ITC (Isotherme Mikrotitrationskalorimetrie)
  • DSC (Differential Scanning Calorimetry)

Molekulargewichtsbestimmung durch Hydrodynamische Methoden

  • statische Lichtstreuung
  • dynamische Lichtstreuung
  • analytische Ultrazentrifugation (Beckman XL-I)

Kristallisation und Röntgenstrukturaufklärung von Proteinkomplexen

Röntgen- und Neutronen-Kleinwinkelstreuung (SAXS, SANS)

Bioinformatische Methoden, 3D-Rekonstruktion und bildgebende Verfahren

  • Sequenzalignment
  • Strukturvorhersage (Molecular Modelling)
  • Computergestütztes Protein-Design
  • 3D Rekonstruktion
  • Programme: Amira, ClustalX, Phylip, Rasmol, WebLabViewer, Quanta, O, Genedoc, Treeview, SwissPDBViewer, Modeller 6

Messung von Sauerstoffbindungskurven

  • Verschiedene Techniken stehen zur Aufnahme von Sauerstoffbindungskurven von Atmungsproteinen stehen zur Verfügung
  • Fluorometrisch-polarographische Methode
  • Gill-Zelle (Bestimmung über die Absorption bei 340 nm)

3D-Rekonstruktion von Organismen und Organen/Bildgebende Verfahren